Порозов Юрий Борисович

Должность: доцент

Кафедра: факультет инфокоммуникационных технологий

Уч. степень: кандидат медицинских наук

Звание: доцент

Стаж: 23 года

Условие работы: Основное место работы

Трудовой договор: с 09/01/2018 по 06/30/2019

Образование:

  • Диплом о высшем образовании (высшее профессиональное); Специальность: лечебное дело; Квалификация: врач;

Наименование направления подготовки и (или) специальности:

Преподаваемые дисциплины:

  • Структурная биоинформатика
  • Основы программирования в приложении к химическим задачам
  • Экспериментальные методы в хемоинформатике и структурной биологии
  • Основы биологии
  • Введение в задачи биоинформатики
  • Производственная практика, аналитическая; проектная
  • Современные теории химической связи и ее приложения
  • Основы биоинформатики

Повышение квалификации:

№ п/п
Тип
Название
Год
Описание
Страна
Город
1
Стажировка
1st French-Israeli Workshop on Cheminformatics
2018
Израиль
2
Конференция
Участие в работе 23-й международной конференции "Интеллектуальные системы в молекулярной биологии" и 14-й европейской конференции по вычислительной биологии
2015
23-ая международная конференция "Интеллектуальные системы в молекулярной биологии" и 14-й европейской конференции по вычислительной биологии
Ирландия
Дублин
3
Курсы повышения квалификации во внешней организации
Повышение квалификации "Стратегический менеджмент и управление проектами"
2014
Повышение квалификации "Стратегический менеджмент и управление проектами"
Российская Федерация
Санкт-Петербург
4
Стажировка
Стажировка
2013
Стажировка
Корея, Республика
Тэгу
5
Стажировка
Стажировка
2011
Стажировка
США
Лос-Анжелес
6
Стажировка
курс повышения квалификации "Управление высокотехнологичными проектами: от научной идеи к коммерческому продукту"
2010
курс повышения квалификации "Управление высокотехнологичными проектами: от научной идеи к коммерческому продукту"
Российская Федерация
Санкт-Петербург
7
Стажировка
Exploring Modular Protein Architecture
2008
Exploring Modular Protein Architecture
Германия
Хейдельберг

Список трудов:

  1. Антирадикальная активность флавоноидов [Тип: Тезисы, Год: 2018]
  2. Radical-catching activity of flavonoids [Тип: Тезисы, Год: 2018]
  3. Protas A., Popova E.A., Mikolaichuk O.V., Porozov Y.B., Mehtiev A.R., Ott I., Alekseev G.V., Kasyanenko N.A., Trifonov R.E. Synthesis, DNA and BSA binding of Pd(II) and Pt(II) complexes featuring tetrazolylacetic acids and their esters. Inorganica Chimica Acta. 2018. Vol. 473. pp. 133-144. [Тип: Статья, Год: 2018]
  4. Методические указания по проведению молекулярного докинга (в печати) [Тип: Учебник, учебное пособие, Год: 2018]
  5. Kashkin V.A., Shekunova E.V., Titov M.I., Eliseev I.I., Gureev M.A., Porozov Y.B., Makarova M.N., Makarov V.G. A new tridecapeptide with an octaarginine vector has analgesic therapeutic potential and prevents morphine-induced tolerance . Peptides. 2018. Vol. 99. pp. 61-69. [Тип: Статья, Год: 2018]
  6. Молекулярный докинг и его верификация в контексте виртуального скрининга [Тип: Учебник, учебное пособие, Год: 2018]
  7. Igolkina A., Porozov Y.B., Chizhevskaya E.P., Andronov E.E. Structural insight into the role of mutual polymorphism and conservatism in the contact zone of the NFR5–K1 heterodimer with the Nod factor. Frontiers in Plant Science. 2018. Vol. 9. pp. 344. [Тип: Статья, Год: 2018]
  8. Kirienko A.N., Porozov Y.B., Malkov N.V., Akhtemova G.A., Le Signor C., Thompson R., Saffray C., Dalmais M., Bendahmane A., Tikhonovich I.A., Dolgikh E.A. Role of a receptor-like kinase K1 in pea Rhizobium symbiosis development. Planta. 2018. pp. in press. [Тип: Статья, Год: 2018]
  9. Радикал-улавливающая активность флавоноидов: компьютерное моделирование и экспериментальные данные [Тип: Тезисы, Год: 2018]
  10. Кадочников В.В., Шандыбина Н.Д., Князев С.Н., Порозов Ю.Б. Программа для ЭВМ "Бета-Твистер 1.0". Федеральная служба по интеллектуальной собственности. 2017. № 2017662295. С. 1. [Тип: Статья, Год: 2017]
  11. Kuzmich N.N., Sivak K.V., Chubarev V.N., Porozov Y.B., Savateeva-Lyubimova T.N., Peri F. TLR4 signaling pathway modulators as potential therapeutics in inflammation and sepsis. Vaccines. 2017. Vol. 5. No. 4. pp. 34. [Тип: Статья, Год: 2017]
  12. АЛГОРИТМ И МАТЕМАТИЧЕСКАЯ МОДЕЛЬ ДЛЯ ВЕРИФИКАЦИИ КРОСС-БЕТА АМИЛОИДНЫХ СТРУКТУР [Тип: Тезисы, Год: 2017]
  13. Develompent of the inhibitor of CIS protein by methods of "Structure-Based Drug Design" [Тип: Тезисы, Год: 2017]
  14. Lutsenko E., Knyazev S.N., Porozov Y.B. A New Approach for Modeling of Conformational Changes of Multi Chain Proteins. Procedia Computer Science. 2016. Vol. 101. pp. 58-67. [Тип: Статья, Год: 2016]
  15. Knyazev S.N., Kalyakin V.Y., Deryabin I.N., Fedorov B.A., Smirnov A.V., Stepanov E.O., Porozov Y.B. Prediction of protein conformational mobility with validation using small-angle X-ray scattering. Biophysics. 2015. Vol. 60. No. 6. pp. 886-892. [Тип: Статья, Год: 2015]
  16. Упорядочивание конформационных переходов белковых молекул по данным малоуглового рентгеновского рассеяния [Тип: Тезисы, Год: 2015]
  17. Князев С.Н., Калякин В.Ю., Дерябин И.Н., Федоров Б.А., Смирнов А.В., Степанов Е.О., Порозов Ю.Б. Предсказание конформационной подвижности белков и оценка ее достоверности с помощью малоуглового рентгеновского рассеяния [Prediction of Protein Conformational Mobility and Evaluation of Its Reliability Using Small-Angle X-ray Scattering]. Биофизика [Biofizika]. 2015. Т. 60. № 6. С. 1069–1076. [Тип: Статья, Год: 2015]
  18. Tamazian G.S., Ho Chang J., Knyazev S., Stepanov E., Kim K., Porozov Y.B. Modeling conformational redox-switch modulation of human succinic semialdehyde dehydrogenase. Proteins: Structure, Function and Bioinformatics. 2015. Vol. 83. No. 12. pp. 2217-2229. [Тип: Статья, Год: 2015]
  19. Koshevoy A.A., Stepanov E.O., Porozov Y.B. Method of prediction and optimization of conformational motion of proteins based on mass transportation principle. Biophysics. 2014. Vol. 59. No. 1. pp. 28-34. [Тип: Статья, Год: 2014]
  20. Кошевой А.А., Степанов Е.О., Порозов Ю.Б. Метод предсказания и оптимизации конформационной подвижности белков путем решения транспортной задачи переноса массы [Method of prediction and optimization of conformational motion of proteins based on mass transportation principle]. Биофизика [Biofizika]. 2014. Т. 59. № 1. С. 37-44. [Тип: Статья, Год: 2014]
  21. Buzdalov M., Knyazev S., Porozov Y. Protein Conformation Motion Modeling using sep-CMA-ES. Proceedings - 2014 13th International Conference on Machine Learning and Applications, ICMLA 2014. 2014. pp. 35-40. [Тип: Статья, Год: 2014]
  22. Knyazev S., Tarakanov S., Kuznetsov V., Porozov Y., Koucheryavy Y.A., Stepanov E. Coarse-grained model of protein interaction for bio-inspired nano-communication. Ultra Modern Telecommunications and Control Systems and Workshops (ICUMT), 2014 6th International Congress on. 2014. pp. 260-262. [Тип: Статья, Год: 2014]
  23. Pershina E.V., Dolnik A.S., Tamazyan G.S., Vyatkina K.V., Porozov Y.B., Pinaev A.G., Karimov S.O., Provorov N.A., Andronov E.E. The Evolutionary Space Model to be Used for the Metagenomic Analysis of Molecular and Adaptive Evolution in the Bacterial Communities. Evolutionary Biology: Genome Evolution, Speciation, Coevolution and Origin of Life. 2014. pp. 339-355. [Тип: Статья, Год: 2014]
  24. The Evolutionary Space Model to be Used for the Metagenomic Analysis of Molecular and Adaptive Evolution in the Bacterial Communities. [Тип: Часть издания, Год: 2014]
  25. The Evolutionary Space Model to be Used for the Metagenomic Analysis of Molecular and Adaptive Evolution in the Bacterial Communities. In P. Pontarotti Editor, “Evolutionary Biology: Genome Evolution, Speciation, Coevolution and Origin of Life”. Springer International Publishing Switzerland. [Тип: Часть издания, Год: 2014]
  26. Evolutionary Biology: Genome Evolution, Speciation, Coevolution and Origin of Life [Тип: Часть издания, Год: 2014]
  27. Моделирование подвижности белка SSADH с использованием градиентного спуска и эвристик [Тип: Тезисы, Год: 2014]
  28. Моделирование подвижности белка SSADH с использованием градиентного спуска и эвристик [Тип: Тезисы, Год: 2014]
  29. Protein Inter-Conformational Movement Modeling Based on Mass Transportation Principle [Тип: Тезисы, Год: 2014]
  30. Porozov Y.B., Muntyan A.N., Chizhevskaya E.P., Simarov B.V., Andronov E.E. Conjugate Symbiotic Populations Part II: Analysis of nfr5 Receptor Gene Polymorphisms Using Molecular Docking. Russian Journal of Genetics: Applied Research. 2013. Vol. 3. No. 2. pp. 146-151. [Тип: Статья, Год: 2013]
  31. Tikhvinskiy D.A., Porozov Y.B. Bioinformatics and tools for computer analysis and visualization of macromolecules. Russian Open Medical Journal. 2013. Vol. 2. No. 1. pp. 0101. [Тип: Статья, Год: 2013]
  32. Никитин Т.А., Порозов Ю.Б. Программная система и информационный банк метаданных третичных структур белков. Научно-технический вестник информационных технологий, механики и оптики. 2013. № 1(83). С. 94-99. [Тип: Статья, Год: 2013]
  33. Спельников Д.М., Порозов Ю.Б., Маслов В.Г., Бухановский А.В. Моделирование конформационно-зависимых свойств белков для рационального дизайна лекарственных препаратов в среде облачных вычислений CLAVIRE. Научно-технический вестник информационных технологий, механики и оптики. 2013. № 5(87). С. 175-176. [Тип: Статья, Год: 2013]
  34. Иголкина А.А., Андронов Е.Е., Порозов Ю.Б. Метод поиска субстратспецифичных областей ферментов класса целлюлаз на основании их первичной и третичной структур [Method of Search for Substrate Specificity Regions in Cellulase Class Enzymes Based on their Primary and Tertiary Structures]. Математическая биология и биоинформатика [Mathematical Biology and Bioinformatics]. 2013. Т. 8. № 2. С. 407-418. [Тип: Статья, Год: 2013]
  35. Тамазян Г.С., Князев С.Н., Степанов Е.О., Порозов Ю.Б. Модель конформационной подвижности белка на основе принципа переноса масс. Информационные технологии и системы - 2013. 2013. [Тип: Статья, Год: 2013]
  36. Igolkina A.A., Andronov E.E., Porozov Y.B. Method of Search for Substrate Specificity Regions in Cellulase Class Enzymes Based on their Primary and Tertiary Structures. Mathematical Biology and Bioinformatics. 2013. Vol. 8. No. 2. pp.  t1-t11. [Тип: Статья, Год: 2013]
  37. Спельников Д.М., Князев С.Н., Балахонцева М.А., Буздалов М.В., Порозов Ю.Б., Маслов В.Г., Бухановский А.В. Высокопроизводительный программный комплекс моделирования конформационно-зависимых свойств белков в задачах рационального дизайна лекарственных препаратов. Динамика сложных систем - XXI век. 2013. Т. 7. № 3. С. 12-16. [Тип: Статья, Год: 2013]
  38. Porozov Y.B., Semenov A.D., Shevnin A.S. PDB-by-RMSD: the New Service and Tool for Searching Protein Structures. American Journal of Bioinformatics Research. 2013. Vol. 3. No. 2. pp. 30-33. [Тип: Статья, Год: 2013]
  39. Protein Inter-Conformational Movement Modeling Based on Mass Transportation Principle [Тип: Тезисы, Год: 2013]
  40. Порозов Ю.Б. Use of BioBlender for all atom morphing of protein structures. EMBNet.Journal. 2012. Vol. 18. pp. 124. [Тип: Статья, Год: 2012]
  41. Андронов Е.Е., Порозов Ю.Б. Концепция универсальной таксономической системы бактерий: эволюционное пространство гена 16S-рРНК v. 1.0. Сельскохозяйственная биологи. 2012. № 5. С. 111-120. [Тип: Статья, Год: 2012]
  42. Порозов Ю.Б. Сопряженные симбиотические популяции. Чаcть ii: анализ полиморфизма рецепторного гена nfr5 с использованием молекулярного докинга. Экологическая генетика. 2012. Т. 10. № 1. С. 12-18. [Тип: Статья, Год: 2012]
  43. Порозов Ю.Б. Концепция универсальной таксономической системы бактерий: эволюционное пространство гена 16S-рРНК v. 1.0. Сельскохозяйственная биологи. 2012. № 5. [Тип: Статья, Год: 2012]
  44. ROLE OF A NEW RECEPTOR-LIKE KINASE K1 IN PEA-RHIZOBIUM SYMBIOSIS DEVELOPMENT [Тип: Тезисы, Год: 2012]
  45. Расширение языка PERL для решения задач биологии [Тип: Учебник, учебное пособие, Год: 2012]
  46. Основы биоинформатики [Тип: Учебник, учебное пособие, Год: 2012]
  47. Порозов Ю.Б. Применение вейвлет-преобразования к задаче поиска сайтов начала репликации в ДНК человека. Математическая биология и биоинформатика (Эл. ж-л). 2011. Т. 6. № 2. [Тип: Статья, Год: 2011]
  48. Метатаксономия для мегатеномики: a simplex problem [Тип: Тезисы, Год: 2011]
  49. Protein conformational movements modeling based on the average action principle [Тип: Тезисы, Год: 2011]
  50. Structural modeling of BCR-ABL drug resistance mutations [Тип: Тезисы, Год: 2011]
  51. Elaboration of protein motion using Blender Game Engine [Тип: Тезисы, Год: 2011]
  52. Порозов Ю.Б. Применение вейвлет-преобразования к задаче поиска сайтов начала репликации в ДНК человека. Математическая биология и биоинформатика (Эл. ж-л). 2011. Т. 6. № 2. [Тип: Статья, Год: 2011]
  53. Порозов Ю.Б. Биоинформатика и средства компьютерного анализа и визуализации макромолекул. Саратовский научно-медицинский ж-л. 2010. Т. 6. № 2. С. 273-276. [Тип: Статья, Год: 2010]
  54. Вычисление оптимальной траектории перехода между конформациями белковых молекул [Тип: Тезисы, Год: 2009]
  55. Порозов Ю.Б. BioBlender: Fast and Efficient All Atom Morphing of Proteins Using Blender Game Engine. Electronic journal arXiv.org. 2009. No. September. [Тип: Статья, Год: 2009]
  56. The problem of NMR model`s ordering. A physical mass-energy transfer model [Тип: Тезисы, Год: 2009]
  57. Порозов Ю.Б. Using Blender for molecular animation and scientific representation. Proc. Blender Conference-2008. 2008. [Тип: Статья, Год: 2008]
  58. Visualization of biological processes using 3D animation [Тип: Тезисы, Год: 2007]
  59. Visualization and modeling of moving biomolecules: a new approach based on professional 3D animation software [Тип: Тезисы, Год: 2007]
  60. 3D visualization of biomolecules: representation of surface properties [Тип: Тезисы, Год: 2007]
  61. Visualization of moving biomolecules: a new approach based on professional 3D animation software [Тип: Тезисы, Год: 2007]
  62. Порозов Ю.Б. G-beta-gamma-dependent and G-beta-gamma-independent basal activity of G protein-activated K+ channels. J. Biol. Chem. 2005. 2005. Vol. 280. No. 17. pp. 16685-16694. [Тип: Статья, Год: 2005]
  63. Биоинформатика – новая наука в системе медико-биологического образования [Тип: Тезисы, Год: 2005]
  64. Порозов Ю.Б. G-alfa_i1 and G-alfa_i3 differentially interact with, and regulate, the G protein-activated K+ channel. J. Biol. Chem. 2004. Vol. 279. No. 17. pp. 17260-17268. [Тип: Статья, Год: 2004]
  65. G-beta-gamma-dependent and G-beta-gamma-independent basal activity in GIRK ion channels [Тип: Тезисы, Год: 2004]
  66. Basal activity of GIRK channels includes G-beta-gamma-dependent and G-beta-gamma-independent components [Тип: Тезисы, Год: 2003]
  67. Методика расчета концентрации гормонов в крови по набору тестов Bio-Rad с использованием ЭВМ [Тип: Сборник, Год: 1999]
  68. Порозов Б.Ю., Порозов Ю.Б. Методика изучения фотореактивности изолированного сердца крысы. Бюллетень экспериментальной биологии и медицины. 1998. Т. 125. № 6. С. 717-720. [Тип: Статья, Год: 1998]
  69. Устройство для демонстрации на ЭВМ аналоговых сигналов [Тип: Тезисы, Год: 1998]
  70. Порозов Ю.Б. Influence of He-Ne laser radiation of pacemaker on the frog`s heart function. Proc. SPIE, edited by Valery V. Tuchin. 1997. Vol. 3053. No. 160. pp. 160-171. [Тип: Статья, Год: 1997]
  71. Влияние гелий-неонового лазерного излучения на деятельность сердца [Тип: Автореферат, Год: 1997]
  72. Modification of the cardiac activity in He-Ne laser irradiation of the pacemaker [Тип: Тезисы, Год: 1996]
  73. Порозов Ю.Б. Influence of He-Ne laser radiation on the frog's heart. Proc. 12 Int. Congress "Laser 95". Ed. W. Waidelich, G. Staehler, R. Waidelich. 1996. pp. 495-498. [Тип: Статья, Год: 1996]
  74. Changes in heart reaction to pacemaker region irradiation by He-Ne laser in different phases of the cardiac cycle [Тип: Тезисы, Год: 1995]
  75. Влияние низкоинтенсивного лазерного излучения на временную инамику гиподинамической депрессии в сердце амфибий [Тип: Тезисы, Год: 1995]
  76. Influence of He-Ne laser irradiation on frogs heart [Тип: Тезисы, Год: 1995]
  77. Сhanges in photoreactivity of heart pacemaker in different phases of the cardiac cycle [Тип: Тезисы, Год: 1995]
  78. Влияние гелий-неонового лазера на развитие гиподинамической депрессии в сердце лягушки [Тип: Сборник, Год: 1994]
  79. Влияние низкоинтенсивного лазерного излучения на изолированное сердце амфибии [Тип: Тезисы, Год: 1994]
  80. Методика изучения влияния импульсного лазерного излучения на сердце [Тип: Тезисы, Год: 1993]
  81. Порозов Ю.Б. Автоматизированный комплекс для изучения влияния прерывистого лазерного излучения на изолированное сердце. Физиол. ж-л им. И.М. Сеченова. 1993. Т. 79. № 7. С. 118-122. [Тип: Статья, Год: 1993]